2024-01-10　『2024第15屆亞太醫學檢驗科學國際研討會』開放報名至3月15日止，請會員把握機會踴躍參與！　 2023-07-01　會員如有權益相關問題及對本會有任何建議或意見回饋，歡迎利用電子信箱或致電本會，謝謝您!! 　 2015-02-02　醫事檢驗師宣誓誓詞，誓詞內容請至文件下載區查閱，並請協助推廣，謝謝！　

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歷年稿件內容

*類別：
* 姓名：	林雅嵐
投稿種類：	口頭
*中文投稿標題：	次世代定序技術分析微生物菌群
*中文作者姓名列：
*中文服務單位：
*英文投稿標題：
*英文作者姓名列：
*英文服務單位：
* 投稿摘要：	傳統的細菌鑑定需耗費多時，且菌落形態上的相似性及生化特性上的變異是造成菌種鑑定及菌株區分的盲點。目前已知細菌序列中16S rDNA具有一定的基因保留性且長度適中(約1500 bp)，適合運用於菌種的鑑定，利用分子技術分析菌種的DNA序列將可提供更準確的鑑定結果。傳統Sanger定序的限制是操作較為繁瑣，且無法同時處理大量樣品，而次世代定序 (Next Generation Sequencing, NGS)的優勢就是能同時獲得大量的定序資料(約10萬~1000萬筆資料)。常見的次世代定序平台有 Illumina (Solexa)、Roche (454)及ABI (SOLiD)，其中Roche (454)焦磷酸定序能提供長片段的序列讀長(長度達500 bp)，能提供準確的比對資訊及組序運用。本實驗目的為建立世代定序技術分析為生物菌群，實驗檢體採用四株已知菌種的菌液混合液，進行核酸萃取後，使用6組引子(Nossaet et al.)進行16S rDNA 擴增，焦磷酸定序部分需進行1.資料庫製備(Library Preparation)、2.乳化擴增PCR (Emulsion PCR, emPCR)及3.焦磷酸方式的定序(Pyrosequencing)。本實驗共獲得31035筆焦磷酸定序資料，讀長可達500bp。定序資料分析部分為1.每筆定序資料去除前後primer的序列長度，留下長度200bp以上的資料。2.去除後的序列資料傳上RDPⅡ(Ribosomal database projectⅡ)的網站進行序列所屬物種之分類並下載結果。3. 挑選在『屬』的分類下定序資料大於100筆以上者。4.利用Newbler軟體進行6段DNA片段組序產生的contig與現有的16S rDNA資料庫進行比對。根據比對結果顯示本實驗技術架構可準確分析四株已知菌種16S rDNA序列。此實驗技術及資料分析具有相當程度的準確性，同時建立”次世代定序技術分析微生物菌群”的可行性。
*關鍵字1 ：	次世代定序技術
*關鍵字2 ：	16S rDNA
*關鍵字3 ：	RDPⅡ
*關鍵字4 ：	Newbler
*關鍵字5 ：	焦磷酸定序
* 服務機關：
* 第一作者：	林雅嵐
* 身分字號：	*****76224
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